A tutela dei depositanti, nell'eventualità di problemi della banca, interviene il Fondo di Garanzia dei Depositanti. Tale Fondo è un'istituzione specifica del Credito Cooperativo, cui tutte le BCC partecipano obbligatoriamente. La garanzia per i depositanti consiste, in via preventiva, nell'attività di controllo esercitata dal Fondo sulla Cassa Rurale di Treviglio e, in determinati casi, nel rimborso dei depositi fino al massimo consentito dalla legge (103.000 euro).

Le BCC, inoltre, hanno dato vita ad un'altro fondo che tutela i clienti e i soci portatori di obbligazioni emessa dalla BCC: il  Fondo di Garanzia  degli Obbligazionisti. L'adesione a tale Fondo assicura (con importi fino a 103.000 euro) il rimborso delle obbligazioni nei casi di difficolta della banca.

In definitiva, un cliente che abbia depositi e sia portatore di obbligazioni può contare su una garanzia complessiva fino a 206.000 euro. 

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